El Informe Sombra utiliza una metodología regional innovadora, con la cual las organizaciones miembros pueden monitorear las “alertas” de violaciones contra la libertad de expresión, la libertad de prensa, el acceso a la información o la seguridad y protección de los periodistas. Estas alertas se clasifican a través de un enfoque de monitoreo de múltiples niveles, donde los datos se alinean con 12 indicadores regionales de Voces del Sur, y los hallazgos se agregan para la presentación de informes. Esta metodología comprende matices nacionales, pero al mismo tiempo provee datos para informes internacionales.